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JTO再添力证:NGS是检测EGFR ex20ins突变的最优选择

JTO再添力证:NGS是检测EGFR ex20ins突变的最优选择

导语

EGFR ex20ins突变是非典型EGFR突变中最常见的类型,占EGFR突变的5%-10%[1]。EGFR ex20ins突变异质性强,已有上百种突变亚型被报道,约10%位于α-C-螺旋的C末端,90%位于α-C-螺旋后的Loop环结构域。目前针对EGFR ex20ins的靶向药物临床研究越来越多,20ins不同插入类型对药物疗效响应也存在差异。Ⅰ期CHRYSALIS研究[2]结果显示,对比EGFR ex20ins突变的不同亚型,近环端插入的客观缓解率(ORR)为41%,优于远环端插入的25%。WU-KONG6研究[3]中,EGFR ex20ins突变近环端插入ORR为62%,远环端插入ORR为54%。综合各项研究数据表明,有效检出EGFR ex20ins突变并正确识别其亚型,对于患者的精准治疗具有重要意义。


聚合酶链式反应(PCR)和二代测序(NGS)是两种常用的突变检测方法,此前报[4]显示,与NGS检测相比,PCR对于EGFR ex20ins突变的遗漏率约为50%。近日,Journal of Thoracic Oncology(JTO)杂志上发表了一项回顾性研究[1]又添力证,研究表明,NGS技术是检测EGFR ex20ins突变的最优选择。该研究纳入了NCT02716116(莫博塞替尼 1/2期研究)临床试验以及四个真实世界队列(LC-SCRUM-Japan、German Chart Review Study、GENIE database、U.S. COTA database)中NGS或其他检测技术检出EGFR ex20ins的非小细胞肺癌(NSCLC)患者,比较了6种广泛使用的市售PCR试剂盒与NGS检测EGFR ex20ins的性能差异。


主要结论


1、PCR漏检率40%以上,NGS检测是首选


研究纳入了636例携带EGFR ex20ins的NSCLC患者,共检出104个不同的EGFR ex20ins突变,不同PCR试剂盒检测到的EGFR ex20ins突变数最多为7个(范围为5-7个),显著少于NGS(表1)。具体看不同PCR试剂盒在各个数据集中的检出情况,通过PCR检测到的EGFR ex20ins患者比例从11.8%到58.9%不等(总人群中为15.3%-45.1%)。PCR检测EGFR ex20ins的漏检率在40%以上。


不同数据集中基于NGS和PCR技术EGFR ex20ins突变的检出情况

表1. 不同数据集中基于NGS和PCR技术EGFR ex20ins突变的检出情况


2、EGFR ex20ins突变亚型众多,NGS检测优势明显


研究检出的104种EGFR ex20ins突变亚型,分布在C末端和Loop环的不同碱基位置,各亚型突变长度不同。PCR试剂盒检测到的常见突变亚型为A767_V769dup、S768_D770dup和H773dup。PCR漏检率较高的突变亚型为N771_H773 dup、D770delinsGY、H773_V774insAH、M766delinsIGQR和N771_P772insH。PCR技术需要预先针对想看的检测位点设计探针,而EGFR ex20ins突变异质性强,传统PCR检测方案不可避免地会出现漏检情况。NGS技术优势在于可通过探针设计,进行全基因覆盖,针对这类异质性强的突变类型,是最优的检测方案。


PCR检测到及未检测到的EGFR ex20ins突变亚型分布。橙色字体:PCR检测到的ex20ins突变亚型;蓝色字体:PCR未检测到的ex20ins突变亚型

图1. PCR检测到及未检测到的EGFR ex20ins突变亚型分布。橙色字体:PCR检测到的ex20ins突变亚型;蓝色字体:PCR未检测到的ex20ins突变亚型


世和NGS全面覆盖EGFR ex20ins,不同亚型TKI疗效存在差异

世和基因基于既往检测数据发现547例(2.24%)患者携带EGFR ex20ins突变,与文献报道的中国肺癌患者中2.1%-2.27%的比例相近。85种EGFR ex20ins突变亚型中,最常见的突变亚型为p.A767_V769dup(25.1%)和p.S768_D770dup(17.6%)(图2A)[5]


中国肺癌患者中EGFR ex20ins突变亚型分布及TKI疗效差异。A:中国肺癌患者中各EGFR ex20ins突变亚型占比;B:不同EGFR ex20ins亚型TKI疗效存在差异

图2. 中国肺癌患者中EGFR ex20ins突变亚型分布及TKI疗效差异。A:中国肺癌患者中各EGFR ex20ins突变亚型占比;B:不同EGFR ex20ins亚型TKI疗效存在差异


EGFR ex20ins不同插入亚型在EGFR-TKI治疗的无进展生存期(PFS)上存在差异 (图2B)。与既往报道一致,携带p.A763_Y764FQEA 亚型的患者PFS较其他亚型长。p.A767_V769dup亚型对不同的TKI显示出不同临床获益,4例患者PFS大于10个月,最长为32个月,而大多数患者在治疗后立即进展或表现出较短的疾病控制时间。p.S768_D770dup对TKI治疗的响应有限(图2B)[5]


结语


EGFR ex20ins突变异质性强,PCR不能完全覆盖各个亚型,漏检率高,NGS是检测该突变的最佳选择。由于NGS技术检测范围全、通量高、灵敏度高等优势已广泛应用于这类少见/罕见靶点的检测。虽然少见/罕见靶点整体发生率低,但由于中国庞大的患者基数,这类患者存在大量未被满足的临床需求。世和基因经过多年检测积累,针对少见/罕见靶点如EGFR ex20ins突变,ERBB2 TMD突变,MET融合,MET 14外显子跳读等取得了多项突破性学术成果。同时世和基因自主研发的世和一号®大Panel联合RNA-Capseq技术,应用自研生信算法,可全面覆盖罕见靶点检测,相关性能在多个行业会议中公布,获得了临床专家的广泛认可。世和基因致力于应用更好的技术服务临床,并携手临床专家开展更多贴合临床需求的转化研究,为肿瘤精准化管理提供更多循证依据。


参考文献


[1] Ou S H I, Hong J L, Christopoulos P, et al. Distribution and detectability of EGFR exon 20 insertion variants in NSCLC[J]. Journal of Thoracic Oncology, 2023, 18(6): 744-754.

[2] Park K, Haura E B, Leighl N B, et al. Amivantamab in EGFR exon 20 insertion–mutated non–small-cell lung cancer progressing on platinum chemotherapy: initial results from the CHRYSALIS phase I study[J]. Journal of Clinical Oncology, 2021, 39(30): 3391-3402.

[3] Wang M, Fan Y, Sun M, et al. Sunvozertinib for the treatment of NSCLC with EGFR Exon20 insertion mutations: The first pivotal study results[J]. 2023.

[4] Bauml J M, Viteri S, Minchom A, et al. FP07. 12 underdiagnosis of EGFR exon 20 insertion mutation variants: Estimates from NGS-based real-world datasets[J]. Journal of Thoracic Oncology, 2021, 16(3): S208-S209.

[5] Qin Y R, Jian H, Tong X, et al. Variability of EGFR exon 20 insertions in 24 468 Chinese lung cancer patients and their divergent responses to EGFR inhibitors[J]. Molecular oncology, 2020, 14(8): 1695-1704.



作者:小N     审核:简爱       排版:Moro


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