CAPItrue研究基于世和一号®大Panel检测，围绕乳腺癌NGS检测中的关键质控因素及PIK3CA/AKT1/PTEN变异特征等展开了系统分析，为乳腺癌NGS检测的规范化应用提供了扎实的数据支持，也为卡匹色替的精准使用提供了参考，彰显了世和基因NGS平台在临床检测中的稳定性与应用价值。
导读：
2026年美国和加拿大病理学会（USCAP）年会于近日圆满落幕，会上发布了一项针对CAPItrue研究入组人群的二代测序（NGS）检测结果分析数据。该分析系统剖析了NGS检测质控情况、核心影响因素及PIK3CA/AKT1/PTEN改变情况，为我国乳腺癌NGS检测的临床规范化应用提供了重要循证依据1。在此背景下，医脉通特邀解放军总医院张少华教授、河北医科大学第四医院刘月平教授，围绕本次NGS检测结果的核心发现，探讨NGS检测实践痛点、质控体系建设及精准靶向治疗路径优化，助力中国HR+/HER2-晚期乳腺癌精准诊疗迈向规范化、个体化新阶段。世和基因为本研究提供了世和一号®大Panel检测和生物信息学分析支持。
思辨为先，HR+/HER2-晚期乳腺癌精准诊疗的现状与瓶颈
耐药是HR+/HER2-晚期乳腺癌治疗中的一大痛点，其中PI3K/AKT通路相关基因变异是导致内分泌、CDK4/6抑制剂、化疗等治疗耐药的重要机制2。随着临床研究的探索，卡匹色替等PI3K/AKT通路抑制剂已被证实可为存在PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变的HR+/HER2-晚期乳腺癌患者带来显著的治疗获益。为实现精准治疗，在HR+/HER2-晚期乳腺癌患者中规范开展PIK3CA/AKT1/PTEN基因检测已成为临床实践的关键环节。得益于“大规模、高效率、低成本”优势，NGS技术已成为PIK3CA/AKT1/PTEN基因检测的关键方式。然而，此前NGS检测在乳腺癌领域的应用并不广泛，多数医院缺少开展NGS检测的技术手段与经验，因此仍需更多证据指导NGS检测与精准治疗决策，以解决临床实践中的常见问题，从而推动NGS检测规范化与精准治疗的落地。
循证为据，CAPItrue研究NGS分析核心成果分享1
在这一背景下，聚焦HR+晚期乳腺癌人群的CAPItrue研究探索性中期分析结果，揭示了基于肿瘤组织NGS检测所获得的PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变情况1，以明确影响NGS检测完成情况的关键因素，为HR+/HER2-晚期乳腺癌的精准治疗提供指导方向。该研究针对CAPItrue（NCT06635447）IIIb期临床试验中内分泌治疗耐药的中国HR+/HER2-晚期乳腺癌患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肿瘤样本进行NGS检测，筛选包括PIK3CA/AKT1/PTEN、ESR1和BRCA1/2在内的基因组改变；优先选择近期获取的转移灶样本，并明确要求骨转移样本不得进行强酸脱钙处理。通过样本采集、DNA提取、文库构建、杂交捕获、DNA测序及生物信息学分析的完整流程，对湿实验和干实验过程进行严格质量控制（QC），将结果分为通过、警告或失败，最终仅对“通过”QC的样本数据进行分析。
结果显示，截至2024年12月23日（期中分析），在纳入分析的样本中，87.8%（65/74）的样本成功通过了QC。质控通过率随标本存储年限增加而明显下降，存储0-2年的样本通过率为90.4%，存储2-5年的为83.3%，而超过5年的样本通过率为80.0%。不同采集部位的通过率为83.3%–100%，其中淋巴结样本通过率为100%。期待后续数据的更新以进一步验证相关结论。
表1 线上培训前后的PPA和NPA值1
对于QC警告与失败原因进行分析发现，在5.4%的警告样本中，平均测序深度均低于阈值，其他影响因素包括DNA提取量低、插入片段过短以及样本存储时间过长；在6.8%的失败样本中，导致失败的主要原因包括有效测序深度不足（2例）、DNA产量低于检测阈值（2例）、样本污染（1例）。
针对通过QC的样本进行基因改变情况分析发现，70.8%的患者存在PIK3CA/AKT1/PTEN任一基因改变；3.1%的患者存在PIK3CA与AKT1共改变，以及PIK3CA与PTEN共改变；PIK3CA/AKT1/PTEN与ESR1共改变率9.2%，与BRCA1/2共改变率3.1%。
图1 基因改变图谱1
本次分析显示，肿瘤样本NGS检测的失败率较低；但样本储存时间延长可能会降低检测通过率。对于初始QC提示异常的样本，可通过技术优化策略，提高靶向治疗相关重要基因变异的检出率。本分析中PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变的发生率高于CAPItello-291研究的报道。考虑到本研究作为一项探索性中期分析，样本量有限且按入组顺序依次检测，因此该点估计值可能易受抽样变异性的影响。
靶向为用，优化精准诊疗策略
张少华教授
规范、可靠的NGS检测，最终目的是为精准靶向治疗奠定坚实基础。尽管由于样本量有限等原因，CAPItrue研究中PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变发生率较高。但在真实世界中，中国HR+/HER2-乳腺癌的上述基因改变比例同样不可忽视，处于较高水平。多项研究发现，约有33~45.2%的中国HR+/HER2-乳腺癌患者存在PIK3CA基因改变，约7.7%的患者存在AKT1改变，约有15.4%的患者存在PTEN改变3,4。这些基因改变可持续激活PI3K/AKT信号通路，是导致内分泌治疗、CDK4/6抑制剂治疗出现耐药的重要原因。因此，HR+/HER2-晚期乳腺癌患者应积极开展PIK3CA/AKT1/PTEN基因检测，尽早明确是否存在相关基因改变，从而把握精准治疗的机会。
在明确靶点的基础上，临床可为这部分耐药患者制定更具针对性的精准治疗方案。CAPItello-291研究已为此提供了强有力的循证证据，研究结果显示，对于内分泌治疗耐药的HR+/HER2-晚期乳腺癌患者，卡匹色替与氟维司群联合治疗PIK3CA/AKT1/PTEN改变人群，PFS较氟维司群单药组显著延长至7.3个月（vs. 3.1个月，P＜0.001），疾病进展或死亡风险降低50%5。同时，研究纳入了69.1%既往接受过CDK4/6抑制剂治疗的患者，且亚组分析结果显示，无论是晚期一线还是二线CDK4/6抑制剂经治的PIK3CA/AKT1/PTEN改变HR+/HER2-晚期乳腺癌患者，卡匹色替联合氟维司群均能为其带来一致PFS获益6。
而实现精准诊疗的关键，离不开稳定、可行的NGS检测平台作为支撑。从本次CAPItrue研究的NGS检测实践来看，整体QC通过率达87.8%，充分印证了现有检测流程具备良好的临床可行性，并有望在优化样本选择后得到进一步完善。这一检测价值也得到了国内外权威指南的一致认可与推荐，《美国国家综合癌症网络（NCCN）乳腺癌临床实践指南》7、《中国抗癌协会乳腺癌诊治指南与规范（2026版）》8、《PI3K/AKT/mTOR 信号通路抑制剂治疗乳腺癌临床应用专家共识（2025版）》9、《乳腺癌生物标志物检测临床应用指南》10、《乳腺癌分子病理检测临床实践指南（2025版）》11等指南均推荐采用NGS检测PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变，以指导精准治疗。此外，本研究还观察到部分患者存在PIK3CA/AKT1/PTEN与ESR1或BRCA1/2共改变。这也提示临床医生需要关注复杂基因改变模式，以评估患者预后或给予适应的精准治疗策略。
质控为本，规范NGS临床检测全流程
刘月平教授
CAPItrue研究的NGS分析结果也为病理医生优化检测流程提供了循证依据。具体而言，研究显示不同取样部位的样本通过率差异不大，但样本储存时间与QC通过率明显相关，储存时间<2年的FFPE样本通过率更高。这一结果或与FFPE样本长期存储会引起核酸的降解相关。既往研究亦发现，约20%保存2年的FFPE样本不满足RNA-NGS检测的要求12。对此，《实体瘤常见驱动基因DNA和RNA高通量测序共检专家共识（2025版）》也推荐尽量选择2年内的FFPE样本，以确保检测的成功性和结果的准确性13。临床实践中可优先检测新近获取的转移灶样本，以准确反映当前的分子标志物状态14。若无法获取转移病灶样本，则可选择对原发病灶进行检测14。对于保存不规范、时间过长的组织样本应谨慎选择，必要时可采取血液样本或其他液体样本作为补充11。
与此同时，需引起重视的是，本研究明确要求骨转移样本不得进行强酸脱钙处理，原因在于强酸会严重破坏核酸结构，导致DNA/RNA提取失败。因此，病理医生应使用温和的EDTA脱钙法，以最大限度保留核酸的完整性，确保检测可行性5。病理科需建立标准操作流程，明确哪些标本可接受、如何处理。
此外，本分析中QC失败/警告的主要原因包括DNA提取量低、DNA插入片段过短及有效测序深度不足。对此，实验室可针对微量样本优化DNA提取与质控流程，确保片段完整性与有效测序深度，通过增加组织投入量、优化聚合酶链式反应（PCR）循环数、增加测序次数或采用平行工作流程等方式，提升变异检出的可靠性，最大限度利用有限样本，避免患者重复活检。
小结与总结
随着卡匹色替等靶向治疗药物的广泛应用，PIK3CA/AKT1/PTEN基因检测的临床重要性日益凸显，这也对病理医生与临床医生提出了新的挑战。本次针对CAPItrue研究入组人群的NGS检测分析，为基因检测的规范开展提供了新的循证依据。研究进一步验证了基于肿瘤组织的NGS检测在中国HR+/HER2-晚期乳腺癌患者中具有较高的QC通过率，在临床实践中具有一定可行性，可用于检测HR+/HER2-晚期乳腺癌的PIK3CA/AKT1/PTEN基因改变情况，识别从卡匹色替治疗中获益的患者。同时，研究提示，在NGS检测中，样本储存时间是影响检测成功率的关键因素，建议临床医生尽量选择储存年限低的样本进行检测。针对导致QC失败/警告的DNA提取量低等因素，病理医生可通过优化技术策略提升QC通过率。
综合来看，该研究为我国HR+/HER2-晚期乳腺癌NGS检测的规范化应用和精准诊疗路径优化提供了有力支撑。未来需在检测标准化、技术可及性、多学科协作等方面持续发力，真正走好“精准筑基、规范前行”的进阶之路。
专家简介
- 张少华 教授 -
解放军总医院肿瘤医学部肿瘤内科副主任
中国临床肿瘤学会（CSCO）理事会理事
CSCO乳腺癌专家委员会常委兼副秘书长
《医学参考报·乳腺病学频道》编辑部主任
- 刘月平 教授 -
河北医科大学第四医院/河北省肿瘤医院病理科主任，博士生导师
中华医学会病理学分会常委
中国临床肿瘤学会（CSCO）肿瘤病理专家委员副主委
中华医学会病理学分会乳腺疾病学组组长
参考资料：
1 Shaohua Zhang, et al. USCAP 2026 P357.
2 中国抗癌协会肿瘤药物临床研究专业委员会, 国家肿瘤质控中心乳腺癌专家委员会, 中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会, 等. 中华肿瘤杂志, 2022, 44(7): 673-692.
3 Ziang Li, et al.2024 SABCS. P3-10-13 Abstract.
4 Tao ZH, et al Front Oncol.2020 Jun 30:10:1023.
5 Turner NC, et al. N Engl J Med. 2023 Jun 1;388(22):2058-2070.
6 Hope S Rugo, et al. 2025 ESMO 526P.
7 NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology (NCCN Guidelines®) Breast Cancer. Version 2.2026.
8 中国抗癌协会乳腺癌专业委员会，中华医学会肿瘤学分会乳腺肿瘤学组. 中国癌症杂志, 2025, 35 (12): 1157-1255.
9 Breast Cancer Expert Committee of the National Quality Control Center for Cancer, et al. Cancer Innov. 2025 Apr 9;4(3):e70008.
10 中华医学会病理学分会,中国抗癌协会乳腺癌专业委员会,国家病理质控中心. 中华病理学杂志,2025,54(10):1039-1049.
11 中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会,国家肿瘤质控中心乳腺癌专家委员会,中国抗癌协会肿瘤基因诊断专业委员会. 中华肿瘤杂志,2025,47(10):929-945.
12 Fujii T, et al. Pathol Int. 2020 Sep;70(9):602-611.
13 中华医学会病理学分会,国家病理质控中心. 中华病理学杂志,2025,54(7):701-709.
14 中国抗癌协会乳腺癌专业委员会. 中华肿瘤杂志, 2025, 47(10): 946-960.
编辑：Phoebe
审校：Ninian
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