案例报道 | DNA+RNA联合检测，揭示儿童胰腺腺泡细胞癌分子特征

导语

儿童胰腺腺泡细胞癌（Pediatric pancreatic acinar cell carcinoma，PACC）是一种来源于胰腺滤泡细胞和终末分支胰管的胰腺高度恶性肿瘤，其临床发病率极低，且缺乏特异性的临床特征。

华中科技大学同济医学院附属同济医院刘爱国教授团队与世和基因合作，报道了一例儿童PACC案例，研究基于世和血默胜™(DNA-NGS)，首次在DNA层面上发现PACC存在新型BRAF-KMT2C融合；RNA层面检出经典的SND1-BRAF融合，体现了BRAF融合驱动PACC发生发展的生物学机制的复杂性。患儿经多学科综合治疗，预后良好。相关研究成果已发表在BMC Pediatrics杂志。

案例介绍

患者为7岁男童，右腹部有一约11cm × 11cm无痛肿块，影像学检查提示为胰头异常肿块，伴轻度胰管扩张（图1A）。术前血清AFP水平升高至23.3 ng/ml，但其他常规肿瘤标志物正常。

手术切除的肿瘤大小约为11.2cm × 11.0cm × 10.8cm，边界清晰，与术前超声检查结果一致。肿瘤主要呈分叶状，表面血管丰富（图1B）。

图1. 影像学及手术病理切片

BCL10和CD10阳性。β-catenin膜阳性。E-cadherin阳性。CgA和CK19部分阳性。Vim、PR、Syn、CK7、AFP（背景高）、glypican-3、PAX-8、CD56、NSE和EMA阴性。PAS染色阳性（图1B）。

病理分期：根据美国癌症联合委员会（AJCC）第8版胰腺癌TNM分期系统，患者被诊断为PACC，分期为T3N0M0，即IIA期。

DNA水平：该研究首次在儿童PACC中发现BRAF-KMT2C融合，该融合发生在BRAF基因的第8外显子和KMT2C基因的第7外显子之间，丰度为27.06%，可能会通过激活BRAF激酶和下游MAPK通路促进肿瘤发生（图2）。

图2. BRAF-KMT2C融合基因示意图

RNA水平：由于染色体片段或融合存在复杂的RNA剪接等因素，基于DNA检测的NGS往往不能完全预测RNA水平上的实际剪接模式。因此，通过RNA-seq进一步验证，研究发现了经典的SND1-BRAF融合基因，丰度为4.28%（图3）。

图3. SND1-BRAF融合基因示意图

分子检测结果提示：BRAF融合可能在PACC的肿瘤发生中发挥重要作用，证实NGS检测PACC融合具有重要价值。

两个融合之间不一致的原因有多种，包括（i）选择性剪接：单个复杂重排可产生不同的剪接变体，根据转录和剪接模式导致不同的融合。（ii）亚克隆变异性：肿瘤异质性可能导致一些细胞表达BRAF-KMT2C融合，而另一些细胞表达SND1-BRAF融合。（iii）转录调控差异：在RNA水平上存在SND1-BRAF融合可能表明肿瘤内的功能偏好，SND1-BRAF融合mRNA更稳定或转录更活跃。DNA+RNA联检，可以在最大程度上检出可能的驱动变异。

治疗过程

患者接受了胰十二指肠切除术（Whipple手术），包括胰腺部分切除、胃部分切除、胆囊切除、胆道引流和经皮腹腔引流。

术后，患者接受了6个周期的改良FOLFIRINOX化疗方案，包括奥沙利铂、伊立替康和亚叶酸钙，每2周一次。期间，患者出现轻度骨髓抑制和白细胞减少，通过白细胞提升治疗后顺利恢复。

第4个化疗周期后，腹部MRI提示腹膜后和肠系膜淋巴结增大，考虑到复发风险，患者接受了放射治疗，照射范围包括术前肿瘤床和腹膜后淋巴引流区，总剂量为45Gy/25次/5周。

为巩固治疗效果，患者还接受了深部热疗，结合化疗（白蛋白结合型紫杉醇）。

随访结果

治疗期间，患者每月接受体检、实验室检查（包括血常规、肝肾功能）和影像学检查（心脏超声、腹部CT、MRI）。所有检查结果均未发现明显异常。术后近两年，患者无复发迹象，健康状况良好，恢复正常上学。

结语

本研究首次报道了儿童胰腺腺泡细胞癌的基因特征及其治疗方案，通过DNA和RNA联合的NGS检测，首次发现了PACC相关的BRAF-KMT2C和经典SND1-BRAF两种基因融合，为儿童PACC的诊断与靶向治疗提供了新的理论依据。同时，研究表明，多学科综合治疗策略在PACC的治疗中具有显著效果，为未来类似病例的治疗提供了宝贵经验。此外，文献回顾显示，儿童和成人PACC的遗传异常存在显著差异，强调了进一步研究儿童特异性遗传异常的重要性。

参考文献