【JSCO 2024】NGS助力食管癌术后管理：肿瘤知情切缘阳性提示预后不良

导语

食管癌是全球常见恶性肿瘤之一。据2022年全球癌症统计数据，食管癌新发病例51.1万，死亡病例44.5万^[1]。我国是食管癌高发地区，其中90%以上是食管鳞癌（ESCC），五年生存率不足20%^[2,3]。尽管手术切除是可手术患者常见治疗方案，但预后差异显著，且与手术切缘状态密切相关。即使在病理学上确认为R0完全切除，许多患者仍面临肿瘤复发风险。这表明传统病理学检测未能充分揭示潜在肿瘤细胞，而分子水平的检测或能提供新策略。

目前，利用高通量测序（NGS）技术检测患者手术切缘状态，可提高预后评估的准确性。世和基因与南方医科大学南方医院蔡开灿教授、卢笛教授团队合作，运用世和一号^®大Panel探索ESCC术后疾病进展预测和预后相关的分子标志物，以指导ESCC的精准治疗。该研究成果已于2024年10月24日至26日在第62届日本临床肿瘤学会（JSCO）年会上公布。

卢笛教授受邀出席JSCO大会，并在上消化道专场作汇报演讲

研究亮点

1. 首创性：首次提出肿瘤知情切缘（tumor-informed margin，TiM）的概念，将阳性定义为患者肿瘤与切缘组织中存在共享突变，并探索其对无病生存期（DFS）的预后价值。

2. 全面性：采用NGS技术对术后切缘、远端正常组织及肿瘤多个组织进行全面基因突变分析，揭示分子层面的差异。

3. 前瞻性：发现TP53突变阳性TiM状态与DFS的关联，为临床提供个性化治疗的理论依据。

研究内容

本研究纳入48例接受手术切除的ESCC患者，采集其手术切除的肿瘤组织、切缘组织及远端正常组织，使用世和一号^®大Panel进行NGS检测，全面分析了ESCC各组织样本的分子图谱特征。研究通过切缘与肿瘤样本间是否存在共享突变，定义患者TiM阳性或阴性状态，并探究了不同TiM状态与DFS的关系。最后，研究结合其他临床因素进行多变量分析，验证了TiM状态在术后管理中的独立预后价值。

研究结果

正常和切缘组织中均存在体细胞突变：正常食管组织样本中体细胞突变比例高达81.8%，切缘组织中为50%，而肿瘤组织样本中为95.8%（表1）。

表1. 手术切缘、正常组织和肿瘤组织中体细胞突变数量

切缘样本的突变模式更接近于肿瘤样本，而非正常组织。切缘组织中的变异等位基因频率（VAF）与肿瘤更为相似，显著高于正常组织（p < 0.0001），且相比于肿瘤组织和正常组织、切缘组织和正常组织，肿瘤组织和切缘组织中的共享突变发生率最高（图1）。

图1. 手术切缘、正常组织和肿瘤组织的突变景观

TP53和NOTCH1突变在三种组织类型中突变频率最高，NOTCH1突变更高发于正常组织，TP53则易发生于肿瘤样本，携带TP53和NOTCH1突变的患者人数在三种组织类型的分布频率具有统计学差异（图2）。

图2. NOTCH1和TP53突变在手术切缘、正常组织和肿瘤组织中的突变模式（上为NOTCH1，下为TP53）

正常组织中的TP53和NOTCH1突变位点与肿瘤样本显著不同。NOTCH1突变在正常组织中富集于第8和第26外显子，而在切缘和肿瘤样本中则分布于不同的外显子上；TP53突变在正常组织中富集于第7外显子，而在肿瘤样本中则集中于第8外显子（图3）。

图3. NOTCH1和TP53基因在手术切缘、正常组织和肿瘤组织中的突变位置

仅以TP53共享突变定义的TiM阳性患者（即当肿瘤与切缘组织中存在相同的TP53基因突变）DFS显著较差（p=0.022），而当排除NOTCH1共享突变时（即肿瘤和切缘存在相同的非NOTCH1基因突变），TiM阳性患者的DFS也明显降低（p=0.031）。ESCC预后主要与TP53密切相关（图4），且均为独立预后因子（图5）。

图4. 不同TiM状态与DFS的关联

图5. 各临床病理特征与不同TiM状态的关联

结语

本研究首次提出肿瘤知情切缘（TiM）概念，利用NGS技术对肿瘤、切缘和正常组织进行全基因组分析，从分子层面揭示了切缘和肿瘤组织存在的遗传变异对无病生存期的预后价值，特别是TP53突变的独特影响。这一研究为ESCC术后管理和个性化治疗提供了新的理论依据和技术手段，也为未来精准医疗的发展开辟了新路径。

参考文献