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世和携手于金明院士团队:NGS揭示直肠癌新辅放化疗预后/预测标志物

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目前,新辅助放化疗(Preoperative neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)、全肠系膜切除术(Totalmesorectalexcision,TME)和辅助化疗的综合三联疗法是局部晚期直肠癌(LocalIy advanced rectal cancer,LARC)的标准护理方法[1]。既往研究表明,nCRT有助于控制局部复发,提高病理完全缓解率,但仍有约30%的患者对nCRT响应不佳,超35%的患者在治疗后快速出现全身性复发[2]世和基因与山东省肿瘤医院于金明院士、袁双虎教授团队在该领域进行合作探索,旨在借助NGS检测挖掘与LARC nCRT疗效预测和预后相关的生物标志物,以便更好地指导LARC的精准治疗。相关研究成果于近期成功发表在Clinical and Translational Medicine(IF=10.6)上。


专家简介


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于金明 院士

山东省肿瘤医院院长

中国工程院院士、博士生导师


  • 山东省肿瘤医院院长

  • 山东省人大常委会委员、教科文卫副主任

  • 山东院士专家联合会首届会长

  • 中央保健联系专家

  • 中国抗癌协会副理事长

  • 中华放射肿瘤学专业委员会名誉主任委员

  • 中国抗癌协会放疗专业委员会名誉主任委员

  • 中国医师协会肿瘤多学科诊疗专业委员会名誉主任委员

  • 山东省抗癌协会理事长

  • 《中华肿瘤防治杂志》等多家杂志主编或副主编


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袁双虎 教授

山东省肿瘤医院胸部放疗二科主任

主任医师、博士生导师


  • 国务院特殊津贴专家

  • 泰山学者

  • 国家“万人计划”科技创新领军人才

  • 中国肿瘤放射治疗联盟(CRTOG)执行主委

  • 中国医师协会肿瘤多学科诊疗专委会副主委

  • 中国临床肿瘤学会非小细胞肺癌专委会常委

  • 中国抗癌协会肺癌专委会常委

  • 中华医学会放射肿瘤学会青委会副主委

  • 《中华肿瘤防治杂志》《Precision Radiation Oncology(PRO)》编辑部主任


研究亮点


1、 nCRT治疗前基线组织中的KRAS突变和MYC扩增是nCRT预后更差的独立预测标志物,而增加放疗剂量可提升该部分人群的nCRT疗效;


2、 手术组织中检出KRAS和FBXW7突变的患者复发风险更高;


3、95%的nCRT疗效较好患者(TRG0-2)未出现体细胞突变增加,而染色体不稳定性水平的降低与nCRT疗效较差显著相关;


4、基于NGS评估的手术切缘状态和nCRT诱导的肿瘤进化模式与nCRT疗效、术后复发风险相关。


研究内容


本研究回顾性纳入76例接受nCRT+TME治疗的LARC患者,共采集治疗前基线样本76例、nCRT和TME后手术肿瘤样本72例、手术切缘样本55例,使用瑞递康®放疗大Panel检测,结合临床信息从治疗前的基线特征、nCRT前后基因图谱的变化、手术切缘状态等多个维度全面揭示LARC nCRT预后/预测相关生物标志物。


研究结果


神经侵犯、MYC扩增和KRAS突变与较差的nCRT反应显著相关


研究对76例患者基线样本进行多变量分析,结果表明神经侵犯、MYC扩增和KRAS突变与较差的nCRT疗效显著相关(图1)。随后,研究结合基因变异情况和nCRT期间的放疗剂量对患者治疗疗效作进一步分层。结果表明,MYC扩增和KRAS突变的患者,与低剂量(<50.4 Gy)组相比,高剂量(≥50.4Gy)组疗效更优(即TRG0-2)(图2)。这表明,基线组织中MYC扩增和KRAS突变是nCRT的潜在疗效预测标志物,或可用于指导nCRT期间的辐射剂量。


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图1. 与nCRT疗效相关的基线分子特征

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图2. 放疗剂量分层后不同基线分子特征人群接受nCRT的疗效分布



nCRT后体细胞突变增加,以及CIS减少与nCRT疗效较差显著相关


研究进一步比较了nCRT前后基因变异的总体差异,结果显示,相较于疗效较差组(TRG3),疗效较好组(TRG0-2)的非同义突变数量显著减少(图3A),且体细胞突变增加的可能性也更小(p=0.017)(图3C),甚至可能清零(图3D),然而TRG3组的染色体不稳定性水平(CIS)显著降低(图3B)。这表明,LARC患者放疗后的基因突变数量、染色体不稳定性水平的变化与nCRT疗效显著相关。


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图3. 不同nCRT疗效组中,治疗前后体细胞突变数量及CIS的变化情况



nCRT前后不同的遗传进化模式与患者预后相关


研究进一步比较了nCRT治疗前(T0)、后(T1)的肿瘤组织基因突变图谱,并将其总结为三种经治前后的进化模式(图4A):1)线性演化:T1中的所有突变来自T0(组1;n=43);2)平行进化:T0和T1具有完全不同的突变谱(组2;n=8);3)分支进化:在T0和T1之间具有部分重合突变(组3;n=21)。结合nCRT疗效分析发现,分支进化模式的患者接受nCRT疗效明显更差(图4B)。此外,结合患者预后信息分析发现,第3组的无病生存期(DFS)显著更差(图4C)。这表明,分支进化模式可能与较差的nCRT疗效和较高复发风险有关。


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图4. 不同进化模式与nCRT疗效和预后的相关性



手术切缘样本的NGS评估状态与患者的术后复发风险密切相关


最后,研究进一步分析了55例患者的配对手术肿瘤(T1)和切缘(T2)样本。尽管所有手术切缘在组织学上均为阴性,但有22例(40.0%)被NGS评估为阳性。此外,被NGS评估为切缘阳性的患者,其复发风险明显更高(图5A)。多变量分析显示,NGS评估的手术切缘阳性、切缘组织中的FBXW7突变与术后复发风险更高显著相关(图5B)。


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图5. NGS评估下的手术切缘状态与患者预后的相关性


结语


本研究纳入76例接受nCRT+TME治疗的LARC患者,采集其治疗前后组织及手术切缘组织,使用瑞递康®放疗大Panel进行NGS检测,并结合患者的临床信息,深入探究了基线分子图谱特征、肿瘤进化模式、NGS评估的切缘状态与患者nCRT疗效和复发风险的相关性。结果表明,治疗前患者肿瘤基线组织中的KRAS突变和MYC扩增可作为nCRT疗效较差的预测生物标志物。而基于NGS评估的手术切缘状态和nCRT诱导的肿瘤进化模式与nCRT疗效和术后复发风险密切相关。总的来说,本研究有利于研究者们加深对LARC患者接受nCRT治疗的疗效预测和预后相关分子标志物的理解,对推动临床LARC的精准治疗发展具有重要意义。


癌症是威胁人类生命健康的重大疾病之一,近30年来,全世界癌症的发病率以每年平均3-5%的速度递增。世和基因作为国内肿瘤精准医学龙头企业,利用技术创新,不断钻坚研微,始终奋斗于肿瘤精准治疗研究的第一线。未来我们期待与更多专家携手同行,加强科研合作,为实现“肿瘤,不应是一场宣判”的美好愿景砥砺前行。


参考文献

[1] Benson AB, Venook AP, Al-Hawary MM, et al. Rectal Cancer, Version 2.2018, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. J Natl Compr Canc Netw 2018; 16: 874-901.

[2] Dong C, Ding Y, Weng S, et al. Update in version 2021 of CSCO guidelines for colorectal cancer from version 2020. Chin J Cancer Res 2021; 33: 302-307.



作者:河豚       审核:Iris       排版:Moro


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