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第20届肺癌高峰论坛专家共识发布:少见突变检测首选NGS大Panel

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2023年3月4日,由中国抗癌协会肺癌专业委员会和广东省临床试验协会/中国胸部肿瘤研究协作组联合主办,第20届中国肺癌高峰论坛在春意盎然的广州举行,全国肺癌领域的学界领袖、临床精英、检测专家齐聚一堂,围绕“罕见突变”相关话题展开系列学术汇报和交流讨论,探讨肺癌精准诊疗未来发展方向。世和基因联合创始人、首席技术官汪笑男受邀出席大会,并在《NGS是少见突变检测的最佳平台吗》讨论环节做引导发言。


世和基因NGS检测

精准设计Panel+多项技术升级,打造少见突变检测最佳平台


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世和基因联合创始人、首席技术官汪笑男


随着肿瘤相关信号通路的深入研究及测序技术的发展,罕见突变靶点层出不穷,新药研发方兴未艾,基于我国庞大的肿瘤患者基数,将有更多患者可受益于精准治疗。然而在罕见突变检测方面,仍有一些亟待解决的问题:应该使用什么检测技术和平台?检测多少靶点才能满足临床最低要求?驱动基因和免疫药物疗效是怎样的关系?怎样看待和挖掘Tissue-agnostic即泛癌种靶点?本次肺高论坛上,临床专家和技术专家们围绕这一话题展开热烈讨论。


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NGS少见突变检测话题引发热烈讨论


NGS的技术特点决定,一次检测即可全面覆盖各类少见罕见突变,并不断发现未知突变,是目前罕见靶点检测最优选。世和基因经过多年检测积累,针对罕见靶点检测(融合、拷贝数变化或跳读等)已有一系列技术优化升级:


  1. DNA结合RNA-Capseq靶向捕获技术,在非小细胞肺癌中可额外检出3.3%的融合阳性;敏感度低至2融合拷贝/ng,对低丰度融合检测具有优势。



  2. 针对CNV检测,自主研发Tranquil®算法,全面提升CNV检测能力。以MET扩增为例,与FISH对比,MET Focal Amplification准确性达97.9%。此外,世和基因积极参与广东省肺癌研究所牵头的MET GCN标准化研究,基于NGS技术实现MET GCN检测并划定阳性阈值(GCN ≥ 6.13),同时实现区分Focal Amplification vs Polysomy。MET抑制剂临床疗效分析证实,NGS检测MET GCN ≥ 6.13的患者,PFS显著获益。



  3. 除检测方法、生信分析方法上的不断升级,世和基因结合多年的大Panel NGS检测数据积累,持续深度挖掘新的少见罕见突变,如ERBB2 ΔE16突变;ERBB2 跨膜结构域(TMD)突变 ,EGFR E19ins等,都很可能是潜在用药靶点或靶向药物耐药机制。


专家共识发布

推荐大Panel的DNA二代测序作为少见驱动基因检测的首选


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吴一龙教授发布本届肺高论坛共识


与会专家围绕少见驱动变异“精准检测”、“同病异治”、“异病同治”、“迈进早期”四个讲题进行汇报和讨论。最后,广东省人民医院、广东省肺癌研究所吴一龙教授作会议总结,并就这四项议题达成以下共识:


  • 共识一:对于少见驱动基因的检测,推荐大Panel的DNA二代测序作为首选,RNA测序作为补充;测序基因Panel至少应包括不少于50个基因的1类变异;


  • 共识二:肺癌 MDT 团队应包括分子肿瘤委员会:分子病理学家;临床分子生物学专家;遗传学专家;生物信息学专家


  • 共识三:关注肺癌之外癌种的驱动基因研究,挖掘tissue-agnostic的可能性;尤其应关注融合、重排的少(罕)基因;


  • 共识四:除了BRAF突变或KRAS和TP53共突变的非小细胞肺癌之外,其他驱动基因阳性NSCLS难于从一线免疫治疗中获益;携带BRAF突变或KRAS和TP53共突变的非小细胞肺癌(NSCLC)患者从ICI中受益最大,而EGFR突变或ALK或ROS1重排通常有较低的肿瘤PD-L1水平和突变负荷。


结语


肺高论坛发展至今已走过20年的历程,始终致力于肺癌和其他胸部恶性肿瘤前沿热点问题探索,受到国内同行的广泛关注,并培养了一大批肺癌领域的领军专家和中青年学者。作为中国肿瘤NGS检测的先行者,世和基因将继续砥砺前行,夯实技术研发与创新,持续优化并探索新靶点、新分子标志物,为更多肺癌患者带去新希望。


作者:YW    审核:小鱼    排版:Moro


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