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【ASCO 2023】世和基因8项研究助力肿瘤全周期精准治疗


ASCO

2023年美国临床肿瘤学会年会(ASCO 2023)于当地时间6月2-6日在芝加哥盛大召开。作为全世界学术水平最高、最具影响力的多学科肿瘤学会议,每年ASCO年会都会吸引世界各地肿瘤学者分享最新研究进展,这些成果不仅努力攻克肿瘤诊疗现存的各类困境,也代表了未来精准医学理念发展的方向。


今年,世和基因基于NGS技术围绕肿瘤全周期展开了全方位探索,8项合作研究成果通过壁报等形式登上了ASCO舞台。这8项研究内容涵盖cfDNA片段组学助力肿瘤早筛早诊、多组学助力临床生物标志物研究、晚期肿瘤耐药机制研究和ctDNA液体活检多场景临床应用等,其中多项成果受到国内外专家关注(点击查看详情)在此,小编将研究成果分类汇总以飨读者,希望为您的临床实践和学术研究带来启发。


世和基因cfDNA片段组学助力肿瘤早筛早诊


研究一

Multi-dimensional cell-free DNA-based liquid biopsy for sensitive early detection of gastric cancer. (Poster, Abstract #4060)

合作团队:

浙江省肿瘤医院程向东教授团队

研究亮点:

基于世和基因MERCURY技术分析183例胃癌和233例非癌受试者的血浆cfDNA片段组学特征,构建了早期胃癌和良性疾病鉴定模型,可准确鉴定早期胃癌。

研究结果:

1) 基于片段组学特征构建胃癌和非癌鉴定模型,训练集和独立验证集AUROC分别为0.962和0.972;

2) 训练集特异性为92.1%,灵敏度为88.2%,验证集特异性为91.5%,灵敏度为91.8%,模型性能优异,具有校正临床分期的潜在价值;

3) 在模拟真实世界大样本筛查中,由于该模型具有更高的灵敏度和更好的检测者依从性,相较于胃镜筛查,可多检出96.3%的胃癌患者。


研究二

Detecting early stage breast cancer using low-depth cell-free DNA fragmentomics: A multi-center cohort study. (Poster, Abstract #3075)

合作团队:

中国医学科学院肿瘤医院刘嘉琦教授团队

研究亮点:

基于世和基因MERCURY技术分析234例乳腺癌和168例乳腺良性结节受试者的血浆cfDNA片段组学特征,构建了乳腺癌和良性结节鉴定模型,模型性能表现突出。

研究结果:

1) 基于片段组学特征构建乳腺癌和良性结节鉴定模型,训练集和独立验证集AUC分别为0.816和0.811;

2) 验证组中,片段组学模型在90%灵敏度下,检出影像学评估为乳腺癌的假阳性率为51.5%,具有校正临床分期的潜在价值;

3) 片段组学风险评分联合传统影像学分级构建的联合诊断模型显示更优性能,训练集和独立验证集AUC分别为0.937和0.928。


世和基因多组学助力临床生物标志物研究


研究三

A pilot phase II trial of neoadjuvant camrelizumab plus nab-paclitaxel and cisplatin (NeoCPC) for locoregionally advanced, resectable squamous cell carcinoma of the head and neck. (Poster, Abstract #6069)

合作团队:

中山大学肿瘤防治中心刘学奎教授团队

研究亮点:

基于世和基因NGS、PD-L1、mIHC等多组学技术,探索了局晚期可手术头颈鳞癌(HNSCC)免疫联合化疗新辅助治疗疗效预测。

研究结果:

1) 局晚期可手术HNSCC免疫联合化疗新辅助治疗客观缓解率(ORR)89.6% (43/48),其中27例进行了手术,17例达到主要病理缓解(MPR)63.0%,包括15例病理完全缓解(pCR)55.6%;

2) HPV阳性、TP53野生型、TERT野生型患者可能获得更好的影像学肿瘤退缩;

3) 肿瘤实质区CD8+ T细胞和M1型巨噬细胞的密度与影像学肿瘤退缩百分比具有统计学相关性(Spearman系数分别为0.405, 0.375, p=0.005, 0.009),HPV阳性或PD-L1表达CPS阳性患者免疫新辅助治疗更容易获得pCR。


世和一号®大Panel助力耐药机制研究


研究四

A four-tier classification system for studying homologous recombination repair gene reversion mutations as a mechanism of resistance to PARP inhibitors and platinum chemotherapy.(Poster, Abstract #3140)

合作团队:

中山大学孙逸仙纪念医院李晶教授团队

研究亮点:

回顾性分析了HRR基因原发和继发突变,首次提出作为PARP抑制剂或含铂化疗治疗耐药机制的HRR基因回复突变四分类系统。

研究结果:

1) 首次提出HRR基因回复突变四分类系统,并展示真实世界典型案例;

2) 首次绘制BRCA1/2回复突变分子谱,证实HRR回复突变在驱动PARP抑制剂和含铂化疗治疗耐药中的作用机制。


研究五

Mechanisms of resistance to tyrosine kinase inhibitor treatments in patients with ROS1 fusion-positive non-small cell lung cancer.(Poster, Abstract #9062)

合作团队:

复旦大学附属肿瘤医院王佳蕾教授团队

研究亮点:

回顾性描述了107例ROS1融合晚期NSCLC患者综合临床特征、疗效及CADD分子动态模拟技术,探究了ROS1融合NSCLC TKI治疗前后的分子特征及潜在耐药机制。

研究结果:

1) 治疗前(基线)、克唑替尼治疗后及洛拉替尼治疗后ROS1依赖性(on-target)和非依赖性(off-target)耐药突变均逐步累加,其中ROS1依懒性突变从零升至62%,而非依赖性突变从22%升至43%;

2) CD74-和SLC34A2-ROS1融合患者对克唑替尼治疗响应更好,但耐药机制复杂,克唑替尼治疗进展后需要通过分子检测指导后续治疗方案;

3) 通过CADD分子动态模拟技术鉴别了4个新的ROS1 依懒性耐药突变(ROS1 L2010M、G1957A、D1988N和L1982V),其中L2010M可能对洛拉替尼、恩曲替尼、卡博替尼和克唑替尼均耐药,G1957A可能对卡博替尼耐药,所有四个突变可能都对克唑替尼耐药。


世和基因ctDNA液体活检多场景临床应用


研究六

Clinical application of ctDNA detection in Chinese pediatric patients with soft tissue sarcoma (STS). (Poster, Abstract #10041)

合作团队:

中山大学肿瘤防治中心张翼鹜教授团队

研究亮点:

前瞻性入组48例中国儿童软组织肉瘤患者,收集27个基线组织样本、48个基线血浆样本和64个动态监测血浆样本,共计27个组织样本和112个血浆样本,所有样本进行世和基因赛康派®肉瘤大Panel检测,探索ctDNA检测在软组织肉瘤中的临床应用价值。

研究结果:

1) 手术患者基线ctDNA检出率87.5%(14/16),不可手术患者基线ctDNA检出率56.3%(18/32),组织与血浆检出突变一致性64.3%,基线组织和血浆TMB分别为3.8个/Mb和3.0个/Mb;

2) 相较于I-III期患者(n=6),IV期患者(n=5)血浆平均丰度(p=0.007)、血浆最大丰度(p=0.0045)、ctDNA浓度(hGE/ml) (p=0.0005)和ctDNA相对丰度(p=0.0083)均更高;

3) 术后ctDNA检出率25%(4/16),动态监测ctDNA检出率75.9%(22/29),ctDNA检出与临床响应相关,尤其与肉瘤相关性更强,而骨转移可能会影响ctDNA检出。


研究七

ctDNA for clonal evolution surveillance and therapeutic efficacy prediction in unresectable locally advanced non-small cell lung cancer under radiotherapy.(Online, Abstract #e20555)

合作团队:

中国医学科学院肿瘤医院王绿化教授、毕楠教授团队

研究亮点:

入组46例行根治性RT/CRT治疗的局晚期NSCLC患者,采集治疗前(TP0)、放疗后4周(TP1)、放疗后1个月(TP2)、放疗后3个月(TP3)以及进展时(TP4)血浆,采用世和基因瑞递康®放疗大Panel进行检测,证实ctDNA可用于根治性放化疗患者克隆进化监测和疗效提示,创新性提出m/mVAF(平均等位基因丰度与最大等位基因丰度之比)评估克隆进化及疗效监测。

研究结果:

1) 在TP0时点,POLE突变特征患者的无进展生存期PFS(HR: 5.23, 95% CI: 1.83-15.45)和总生存期OS(HR: 20.68, 95% CI: 3.94-108.62)显著更差;

2) TP4与TP0突变谱一致,TP4很少观察到新发突变/丢失突变;

3) 在TP0,相对较低的m/mVAF和未检出ctDNA,较高的m/mVAF预示肿瘤类型为亚克隆占比低的类型(p<0.01),提示相对较差的生存,并通过431例接受根治性RT/CRT治疗的局晚期NSCLC独立外部验证集验证其预后价值;

4) 从TP0至TP1,m/mVAF增加,提示疾病进展(HR: 3.49, 95% CI: 1.20-10.16)和远端转移(HR: 2.85, 95% CI: 0.84-9.69)风险增加。


研究八

Genomic alterations of cerebrospinal fluid cell-free DNA in leptomeningeal metastases of gastric cancer.(Online, Abstract #e16022)

合作团队:

河北医科大学第二医院卜晖教授团队

研究亮点:

胃癌脑膜转移临床非常罕见,预后较差,本研究基于2016-2020年间河北医科大学第二医院接诊的15例患者,首次证实:脑脊液ctDNA是反映胃癌脑膜转移基因变异和脑膜转移发生机制、评估预后的更优媒介。

研究结果:

1) 对比15例胃癌脑膜转移患者原发灶肿瘤组织和脑脊液样本的遗传变异情况发现,脑脊液和肿瘤组织突变检出中位一致性为83.3%。对其中5例患者的原发性肿瘤组织、脑膜转移后脑脊液和脑膜转移后血浆样本匹配分析发现,脑脊液相较于组织和血浆可检测到更多的遗传改变,可以更好反映胃癌脑膜转移突变特征;

2) 对比原发性胃肿瘤组织和脑脊液样本发现,脑脊液中CCNE1、MYC、CDKN2A和PTEN基因突变频率高于原发灶组织;分子进化系统分析发现MYC和CCNE1在脑膜转移后脑脊液分支中进化发育,表明MYC和CCNE1扩增可能是促进胃癌脑膜转移的原因;

3) 脑脊液ctDNA中CCNE1基因扩增与患者OS显著相关(p=0.0062),胃癌脑膜转移病例显示,脑脊液ctDNA动态变化与临床评估密切相关;

4) 相较于原发组织和血浆,脑脊液可检出更多独有的分子变异,更全面地展示胃癌脑膜转移基因变异情况和脑膜转移发生机制,评估预后。


结语


近年来,世和基因始终保持着强劲的发展势头,在学术探索道路上孜孜不倦,为肿瘤全周期管理提供有力支持,引领行业发展。世和基因自主研发(1) 大Panel产品:世和一号GENESEEQ PRIME®、瑞递康Radiotron®、赛康派Sarcopact®;(2)全周期MRD监测产品术宁Ultra和愈宁Armoring™;(3) MERCURY多组学液体活检早筛技术,不断在世界顶级学术舞台上唱响世和好声音。从晚期到围术期再到早期,从分子特征揭示到临床应用价值深挖,世和与诸多临床专家携手,共同为肿瘤的早筛早诊早治谋求新技术,为患者诊治探索新方法。


作者:Klicking      审核:Xtinee      排版:Moro


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