转录组广义上指某个物种或特定细胞在某一生理条件下产生的所有RNA，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运 RNA（tRNA） 及非编码RNA（Non-coding RNA）等，狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序（Transcriptome sequencing）即是利用高通量测序平台快速全面获得某一物种在某一状态下特定组织或细胞中几乎所有的转录本序列，可以在基因序列结构（可变剪接及融合基因预测）水平和基因表达水平两个方面进行研究。在人类疾病研究、动植物个体发育、逆境胁迫及分子育种中有广泛的应用。