全转录组测序(Total RNA-seq)
全转录组测序(Total RNA-seq)

高通量建库测序

全转录组测序,顾名思义是针对特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息包含mRNA、Small RNA、LncRNA、CircRNA等编码和非编码RNA进行高通量测序研究。生物体的生理活动是一个错综复杂的网络,不同类型分子协同作用共同调控机体的生命活动,全转录组测序可以整合多种RNA信息进行分析,帮助科研工作者探索潜在的调控网络,更深入解释科学问题,在疾病机理、动植物基础研究中有广泛应用。
技术流程
技术参数
测序策略 推荐数据量 测序读长 测序平台 标准分析周期
LncRNA/mRNA/CircRNA 15G Cleandata PE 150 Illumina NovaSeq 6000 21个工作日
miRNA 20M Reads PE 150 Illumina NovaSeq 6000 21个工作日
样品要求
样品类型 Total RNA、细胞、组织等
样本总量 ≥ 3ug,浓度≥100ng/ul
样本质量 OD260/280 值在 1.8-2.0 之间,RIN ≥ 7,5S 峰正常,干冰邮寄
全转录组标准分析内容
miRNA-mRNA互作分析
miRNA对基因的剪切/抑制
miRNA-LncRNA互作分析
LncRNA对miRNA诱骗作用/miRNA的前体分析
miRNA-CircRNA互作分析
CircRNA对miRNA吸附作用
CeRNA调控网络分析
CeRNA整体调控研究
差异CircRNA的靶miRNA预测
5
 
差异miRNA与靶基因的调控网络分析
 
差异miRNA与靶基因的调控网络分析
LncRNA与靶基因调控网络分析
 
LncRNA与靶基因调控网络分析

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