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全转录组测序(Total RNA-seq)
全转录组测序(Total RNA-seq)
高通量建库测序
全基因组重测序(WGS)
全外显子组测序(WES)
普通真核有参转录组测序(mRNA-seq)
全转录组测序(Total RNA-seq)
全基因组甲基化测序(WGBS)
染色质免疫共沉淀测序(CHIP-seq)
全转录组测序,顾名思义是针对特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息包含mRNA、Small RNA、LncRNA、CircRNA等编码和非编码RNA进行高通量测序研究。生物体的生理活动是一个错综复杂的网络,不同类型分子协同作用共同调控机体的生命活动,全转录组测序可以整合多种RNA信息进行分析,帮助科研工作者探索潜在的调控网络,更深入解释科学问题,在疾病机理、动植物基础研究中有广泛应用。
技术流程
Total RNA样本
两种文库构建
文库质检
上机测序
数据分析
技术参数
测序策略
推荐数据量
测序读长
测序平台
标准分析周期
LncRNA/mRNA/CircRNA
15G Cleandata
PE 150
Illumina NovaSeq 6000
21个工作日
miRNA
20M Reads
PE 150
Illumina NovaSeq 6000
21个工作日
样品要求
样品类型
Total RNA、细胞、组织等
样本总量
≥ 3ug,浓度≥100ng/ul
样本质量
OD260/280 值在 1.8-2.0 之间,RIN ≥ 7,5S 峰正常,干冰邮寄
全转录组标准分析内容
miRNA-mRNA互作分析
miRNA对基因的剪切/抑制
miRNA-LncRNA互作分析
LncRNA对miRNA诱骗作用/miRNA的前体分析
miRNA-CircRNA互作分析
CircRNA对miRNA吸附作用
CeRNA调控网络分析
CeRNA整体调控研究
差异CircRNA的靶miRNA预测
差异miRNA与靶基因的调控网络分析
LncRNA与靶基因调控网络分析
联系我们
400-636-2325
投资者联系: 025-58964309
工作咨询:
hr@geneseeq.com
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