全外显子组测序(WES)
全外显子组测序(WES)

高通量建库测序

全外显子测序(Whole Exome Sequencing,WES)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕获并富集后进行高通量测序并针对外显子区域进行变异位点检测的研究方法。由于外显子测序只需针对人类基因组约1%的外显子区域测序,因此,该技术具有简便、经济、高效等优点,可以做到高深度测序,变异检测更加精确。利用外显子组测序可检测与疾病相关的编码区及UTR区域内的序列变异。结合现有的公共数据库提供的外显子数据,可以更好地解释与变异相关的致病机理。
技术流程
技术参数
推荐数据量 测序读长 测序平台 标准分析周期
100X PE 150 Illumina NovaSeq 6000 21个工作日
(仅建库测序10个工作日)
样品要求
样品类型 DNA、血液、组织、细胞等
样本总量 DNA≥200ng;cfDNA≥50ng
样本质量 OD260/280在1.8-2.0之间,DNA无污染、无降解
标准分析内容
1.原始数据质控:低质量数据过滤
2.与参考基因组比对:测序深度及覆盖度统计
3.变异检测及注释:
 a.Somatic SNV/Indel检测及注释
 b.Germline SNV/Indel鉴别与注释
4.CNV检测
结果展示
比对率、重复率、覆盖度统计
 
比对率、重复率、覆盖度统计
 
GATK&VarScan变异检测分析
 
GATK&VarScan变异检测分析
 
突变注释
 
 
突变注释
 
拷贝数变异(CNV)检测
 
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