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全基因组甲基化测序(WGBS)
全基因组甲基化测序(WGBS)
高通量建库测序
全基因组重测序(WGS)
全外显子组测序(WES)
普通真核有参转录组测序(mRNA-seq)
全转录组测序(Total RNA-seq)
全基因组甲基化测序(WGBS)
染色质免疫共沉淀测序(CHIP-seq)
全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐(Bisulfite)处理方法和Illumina高通量测序平台NovaSeq相结合,对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平测序。WGBS可以精确到单碱基分辨率,精确分析每一个C碱基的甲基化状态,从而构建全基因组甲基化图谱。WGBS可以达到全基因组覆盖 , 是研究甲基化水平的“金标准”。
技术流程
DNA样本
SWIFT甲基化
文库构建
文库质检
上机测序
数据分析
技术参数
推荐数据量
测序读长
测序平台
标准分析周期
30X
PE 150
Illumina NovaSeq 6000
21个工作日
样品要求
样品类型
DNA、血液、组织、细胞等
样本总量
DNA≥200ng;cfDNA≥50ng
样本质量
OD260/280在1.8-2.0之间,DNA无污染、无降解
标准分析内容
1.原始数据处理:去除接头及低质量Reads
2.测序数据产出统计及质量评估
3.与参考基因组序列的比对分析
4.甲基化C位点检测
5.C位点的甲基化水平分析
6.甲基化C位点的密度统计
7.基因功能元件甲基化水平分析
8.差异甲基化区域(DMR)鉴定及图谱绘制
9.差异甲基化区域(DMR)的位置及相关基因注释
10.差异甲基化区域(DMR)相关基因的GO和KEGG分析
11.全基因组DNA甲基化可视化分析
12.DMR相关基因蛋白互作网络分析
结果展示
全基因组甲基化水平分析
基因组功能区域甲基化水平分析
差异甲基化区域分析
相关性分析
全基因组甲基化图谱分析
联系我们
400-636-2325
投资者联系: 025-58964309
工作咨询:
hr@geneseeq.com
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