全基因组甲基化测序

全基因组甲基化测序（WGBS）

高通量建库测序

全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是将重亚硫酸盐（Bisulfite）处理方法和Illumina高通量测序平台NovaSeq相结合，对有参考基因组信息的物种进行全基因组范围内的甲基化水平测序。WGBS可以精确到单碱基分辨率，精确分析每一个C碱基的甲基化状态，从而构建全基因组甲基化图谱。WGBS可以达到全基因组覆盖 , 是研究甲基化水平的“金标准”。

技术流程

DNA样本
SWIFT甲基化
文库构建
文库质检
上机测序
数据分析

技术参数

推荐数据量	测序读长	测序平台	标准分析周期
30X	PE 150	Illumina NovaSeq 6000	21个工作日

样品要求

样品类型	DNA、血液、组织、细胞等
样本总量	DNA≥200ng；cfDNA≥50ng
样本质量	OD260/280在1.8-2.0之间，DNA无污染、无降解

标准分析内容

1.原始数据处理：去除接头及低质量Reads
2.测序数据产出统计及质量评估
3.与参考基因组序列的比对分析
4.甲基化C位点检测
5.C位点的甲基化水平分析
6.甲基化C位点的密度统计
7.基因功能元件甲基化水平分析
8.差异甲基化区域（DMR）鉴定及图谱绘制
9.差异甲基化区域（DMR）的位置及相关基因注释
10.差异甲基化区域（DMR）相关基因的GO和KEGG分析
11.全基因组DNA甲基化可视化分析
12.DMR相关基因蛋白互作网络分析

结果展示

全基因组甲基化水平分析