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世和基因ctDNA研究成果亮相广州淋巴瘤高峰论坛

2022年7月8日-9日,由中国老年保健协会淋巴瘤专业委员会主办,中山大学肿瘤防治中心承办的“2022年广州淋巴瘤高峰论坛(GLSF)”在广州成功举办,线上同步转播,观看人数高达万人。本次会议由广东省抗癌协会理事长管忠震教授担任大会荣誉主席,中山大学肿瘤防治中心黄慧强教授、姜文奇教授,南方医科大学南方医院刘启发教授、冯茹教授担任大会主席。


在此次会议中,中山大学肿瘤防治中心张翼鷟教授分享了《ctDNA动态监测在儿童及青少年淋巴母细胞淋巴瘤中的应用》、黄慧强教授分享了《ctDNA在淋巴瘤中的最新临床研究进展》,世和基因有幸参与了两位教授所分享的部分研究,小编将其整理出来以供临床交流学习。


张翼鷟教授主题分享


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张翼鷟教授主题分享


淋巴母细胞淋巴瘤无论在成人还是在儿童中都是一个比较重要的病理类型,临床仍需对两者之间的区别作进一步探索。张翼鷟教授牵头与世和基因合作的多中心儿童淋巴瘤ctDNA动态监测研究从2020年8月至今,共入组了280例儿童淋巴瘤患者,包括以成熟B细胞为主的各个病理类型。本次会议中主要对其中68例淋巴母细胞淋巴瘤患者的数据进行汇报,并通过三例T淋母典型案例的讲解,进一步阐述了ctDNA动态监测与疗效之间的关系。


研究成果分享


68例患者中,50例为T淋母,18例为B淋母。在T-LBL中,基线血浆检出率为97.14%。在B-LBL中,基线血浆检出率为100%。在T-LBL中,最重要的分子学异常是NOTCH1基因的激活突变,本研究中高频基因变异为NOTCH1、CDKN2A/B、JAK1、FBXW7,PTEN等。在B-LBL中常见NRAS基因突变。与组织相比,基线血浆样本突变检出灵敏度为73.83%(N=18),与组织保持良好的一致性。在T-LBL中,ctDNA动态监测与临床疗效一致性较高。


典型案例:1)一例T-LBL中危组患者诱导化疗后ctDNA转阴,巩固化疗结束后血浆ctDNA复阳,ctDNA比影像学提早2个月发现肿瘤复发2)一例T-LBL患者诱导诱导化疗结束后血浆ctDNA仍为阳性,PET-CT也显示肿瘤残留,提示患者可能预后不良,临床定位高危组, 该案例显示血浆ctDNA与影像学疗效评价一致3)一例T-LBL,伴混合T/髓系白血病患者,高危组,在诱导VDLP、CAM、及2程巩固BLOCK化疗后ctDNA检测结果均为阴性,但是在巩固化疗4程后复阳,CT也提示肿瘤增大,此例患者后续进一步跟踪,提示ctDNA结果能反应临床疗效


本研究初步证实ctDNA在淋巴母细胞淋巴瘤中动态监测的可行性,但是仍然需要扩大样本量和长期随访,进一步探究ctDNA动态监测在中国儿童和青少年淋巴母细胞淋巴瘤中的预后价值、复发耐药机制;完善中国儿童和青少年淋巴母细胞淋巴瘤的分子特征,希望能从分子遗传学层面进一步细化预后分层,以推动更精准的个体化治疗。


专家讨论


就张翼鷟教授的分享,临床专家提出了ctDNA是否能检测淋巴瘤MRD,ctDNA检测时间点设置,和多基因检测结果与淋母预后评估等问题。


张翼鷟教授回答:目前ctDNA检测还不能取代PET-CT在淋巴瘤MRD监测中的地位,但是的确提供了除PET-CT等常规手段外进行淋巴瘤MRD监测的新方法,也显示了较好的潜能。ctDNA检测时间点主要和临床治疗疗效评价时间保持一致。NOTCH1基因虽然在T淋母中提示预后良好,但是如果伴随了其他基因变异,例如PTEN基因变异,也会表现出预后差,所以需要综合评估。


黄慧强教授主题分享


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黄慧强教授主题分享


部分淋巴瘤患者存在治愈的可能性,找到关键的biomarker(分子标志物)至关重要。ctDNA在辅助淋巴瘤鉴别诊断、预后评估、动态监测等方面的价值日益凸显。会议中,黄慧强教授系统性地从ctDNA辅助淋巴瘤诊断分型;ctDNA在CAR-T细胞治疗中协助预后判断的新进展;ctDNA的淋巴瘤疗效评估和预后判断价值等新发现三个方面为我们分享了近年来ASH、EHA等国际会议报道的相关进展和最新研究成果。特别介绍了黄教授团队两项与世和基因合作创新性研究成果。


研究成果分享


1、ctDNA动态监测提示MIT方案在初治原发中枢淋巴瘤(PCNSL)中的临床疗效(图1)。


本研究共纳入9名初诊PCNSL患者。MIT方案(大剂量甲氨蝶玲联合伊布替尼、替莫唑胺)诱导治疗6个疗程,每2个疗程通过脑MRI、FDG-PET和脑脊液检查评估治疗反应。所有样本均采用世和基因淋巴瘤NGS检测,MIT治疗期间收集了4例患者(其中3例CR)的脑脊液和血浆样本,进行连续的ctDNA动态监测,发现MIT方案诱导治疗对初诊PCNSL患者疗效高且安全性良好。3例CR患者在MIT治疗1个疗程后脑脊液/血浆中ctDNA变为阴性,与影像学疗效评估结果相似,而1例PR患者ctDNA结果始终未能转阴。表明ctDNA检测能够比较客观反映PCNSL患者的肿瘤负荷和临床疗效,该多中心研究仍在进行中。


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图1 ctDNA动态监测提示MIT方案在初治原发中枢淋巴瘤中的临床缓解质量


2、房水和玻璃体液ctDNA检测辅助玻璃体视网膜淋巴瘤(VRL)的诊断和治疗监测(图2A、B)。


本研究首次采用世和基因血默胜475基因大Panel对15例VRL患者基线房水(AH)和/或玻璃体液(VF)样本进行测序分析,发现房水和玻璃体液ctDNA检出变异具有高度一致性,且房水分子图谱对VRL的诊断和治疗监测同样具有重要的临床应用价值,提示房水是原发眼淋巴瘤的可靠的替代样本类型


黄教授特别指出,原发中枢淋巴瘤患者,很少外周血受累,所以测外周血的价值不大,但是这部分患者脑脊液的ctDNA检测,特异性几乎能达到100%。脑脊液ctDNA阳性是提示患者中枢侵犯的早期比较准确指标。疗效评估方面,目前VRL患者没有很好的疗效指标,往往是根据患者的视力变化来进行评估,研究团队通过5名患者在整个治疗过程中收集AH或VF样本,发现ctDNA突变丰度和IL-10变化水平一致,提示房水中ctDNA突变丰度是原发眼淋巴瘤更精准的诊断和疗效评估指标,前瞻性研究拟尽快开展


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图2A 房水和玻璃体液ctDNA检测辅助玻璃体视网膜淋巴瘤的诊断和治疗监测

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图2B 房水和玻璃体液ctDNA检测辅助玻璃体视网膜淋巴瘤的诊断和治疗监测


专家讨论


就黄慧强教授的分享,临床专家提出了以下问题:技术层面上如何保证ctDNA不会出现假阴性或者假阳性的情况?检测哪种类型淋巴瘤ctDNA更能帮助到临床?


黄慧强教授及其团队认为:从采样到运输再到提取上机以及后续的生信分析,每一个环节都需要注意严格质控,例如在采样时需要注意采样时间节点以及混匀程度,提取时要避免取到中间白细胞层以防稀释肿瘤ctDNA浓度。目前脑脊液、房水等是肿瘤ctDNA含量最纯的媒介,没有其他细胞的干扰,包括在流式阴性的情况下,ctDNA还有20%的阳性率。大概有30%左右的阳性患者会出现中枢临床侵犯,可以适当开展相关开展相关临床干预临床研究,这部分患者可以很好地从ctDNA检测中获益。黄教授表示,ctDNA检测技术在具体运用到提升治疗效果上仍然值得临床进一步探索,但国际上已经有根据ctDNA丰度等指标进行的前瞻性研究,希望未来国内也能出现相关的前瞻干预式研究。


结语


NGS技术发展至今,在精准医学中的应用越来越广泛。ctDNA作为一个优异的分子标志物,在临床中已经起到重要的作用。无论是在成人还是儿童,无论是血浆样本还是脑脊液、房水、玻璃体液等特殊样本,ctDNA在辅助淋巴瘤诊断、预后、复发监测等方面的临床价值都已经逐渐得到科学验证和广泛关注。世和基因专注于肿瘤精准医学领域的临床转化研究,拥有近10年的技术研发和临床实践经验,在淋巴瘤领域,研究成果丰硕,检测经验丰富。相信在未来,世和基因可以和临床专家共同努力,进一步推动淋巴瘤的精准治疗。


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世和基因致力于肿瘤精准医疗、伴随诊断及临床转化研究,为医院提供一站式NGS解决方案;中国独角兽企业


NGS及液体活检实验室获CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证,197次通过国家卫健委临检中心室间质评


公司核心技术人员参与发表以及公司参与临床研究项目发表SCI论文共420多篇,总影响因子(IF)超3500分;2020年度江苏省科学技术二等奖:“肺癌精准医学高通量测序检测技术的创新与产业化”项目;拥有发明专利22项(其中境内20项),其中形成主营业务收入的发明专利19项


2018年,公司研发的“EGFR / ALK / ROS1 / BRAF / KRAS / HER2基因突变检测试剂盒(可逆末端终止测序法)”获得国家药监局注册审批,系国内同期首批获准上市的肿瘤伴随诊断高通量基因检测产品之一


基于ATG-Seq等液体活检技术的CALIBRATE系列多癌种围术期大型临床研究成果相继发表。2021年5月,前瞻性多中心早中期肠癌术后ctDNA MRD大型临床研究(CALIBRATE-CRC)成果发表于J Hematol Oncol(IF=23.2);2021年9月,液体活检预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究(CALIBRATE-RC-nCRT)成果发表于PLoS Med(IF=11.6);2021年11月,前瞻性早中期肺癌术后ctDNA MRD大型临床研究(CALIBRATE-NSCLC)成果发表于Nature Comms(IF=17.7);2022年5月,ctDNA预测局晚期NSCLC精准放化疗疗效大型临床研究(CALIBRATE-LC/EC-CRT)成果发表于Mol Cancer(IF=41.4)


基于MERCURY多组学液体活检技术的DECIPHER系列多癌种早筛研究成果相继发表。2021年10月,大型肠癌早筛临床研究(DECIPHER-Colon)成果发表于J Hematol Oncol(IF=23.2);2021年12月,大型肝癌早筛临床研究(DECIPHER-Liver)成果发表于Hepatology(IF=17.3);2022年6月,国内首个大型泛癌种早筛研究(DECIPHER-Multi)成果发表于Mol Cancer(IF=41.4);2022年6月,大型肺癌早筛临床研究(DECIPHER-Lung)成果发表于eBioMedicine(IF=11.2)