2024 SGO口头报告：世和基因子宫内膜癌早筛模型敏感性达96.4%

子宫内膜癌（Uterine corpus endometrial carcinoma，UCEC）是妇科常见癌种。临床实践中，UCEC的发现主要基于妇科超声检查及宫腔镜有创检查，被检者往往依从性不佳。UCEC目前尚缺乏标准筛查手段，无法做到“早发现，早干预”，间接导致20%到30%的UCEC患者在初诊时已进入中晚期。液体活检是近几年新兴的筛查方式，其在UCEC中性能如何呢？

2024年第55届美国妇科肿瘤学会（SGO）妇科肿瘤年会上，福建省肿瘤医院徐沁教授团队与世和基因合作的基于cfDNA片段组学技术的子宫内膜癌早筛研究入选口头报告。该研究基于三种cfDNA片段组学特征构建的早筛模型对I期UCEC表现出了96.4%的敏感性，并首次证实了片段组学技术用于子宫内膜癌早期筛查的可行性，为妇科肿瘤的早期筛查提供了新思路和新方法。

研究内容

研究入组了共240例受试者（包括UCEC和健康人）的外周血样本。以2021年8月至2022年9月的入组患者作为训练集，2022年11月至2023年2月入组的患者为独立验证集（图1），47例子宫肌瘤患者为特异性验证集。该研究基于“世和早筛样本管理系统”进行收样和信息管理。样本采集条件一致性较好，临床信息管理完善。

图 1. 片段组学用于UCEC筛查的队列设计

研究采用WGS全基因组测序技术并分析了三种片段组学特征，拷贝数变异（Copy number variation，CNV）、核小体印记（Nucleosome footprint，NF）和片段分布（Fragment size distribution，FSD）。CNV特征中，UCEC存在文献报道一致的Chr1.q扩增；NF特征中，UCEC差异表达的转录因子富集在癌症和免疫相关的通路中；FSD特征中，UCEC短片段分布比例高的染色体如Chr1,10,6,11,17等也是UCEC高频突变区域（图2）。

图 2. UCEC和健康人FSD片段分布差异

模型在验证集中的AUC为0.994，在95.5%特异性下敏感性为97.8%（图3），I期敏感性为96.4%，II到IV期敏感性100%。临床病理分期和得分有正相关趋势，晚期样本的肿瘤丰度更高，得分也更高。此外模型也可对子宫肌瘤患者实现较好的排除，特异性达91.5%。

图 3. 验证集中模型的性能

结语

本研究通过严谨的队列设计和完善的样本库管理系统实现了小样本量UCEC单中心早筛研究。运用目前较为灵敏的片段组学技术实现了UCEC较高的早筛性能，为妇科肿瘤早期筛查提供了新方法，也为其他缺少标准筛查手段的癌种提供了新思路。