克隆性造血 (Clonal hematopoiesis, CH)涉及造血干细胞中与白血病相关的体细胞突变的积累,可导致克隆扩增,且容易引发血液恶性肿瘤。CH相关突变通常存在于实体瘤患者的血液及肿瘤组织中,干扰肿瘤突变图谱分析结果。2019年,《Nature Medicine》杂志上刊发了一篇MSKCC和GRAIL研究团队的重要研究成果,提出肿瘤患者血液中 53.2%的cfDNA突变来自血液中的白细胞,而不是肿瘤细胞,罪魁祸首是CH突变。因此,评估CH突变的发生率和临床意义有利于优化精准治疗方案。近日,国家卫生健康委临床检验中心李金明主任团队和广州医科大学附属第二医院朱康顺教授、黄文薮教授团队等与世和基因合作,采用世和一号®大Panel,分析了不同实体瘤患者的配对肿瘤-血液样本,首次探究了中国癌症患者的CH突变特征,揭示了在临床实践中,尤其在针对靶向治疗时,对匹配正常样本进行测序的必要性,相关学术成果发表在Clinical and Translational Medicine (IF=7.919)。
在评估CH突变与免疫治疗标志物的相关性中发现,CH+和CH-患者中MSI的比例相当 (2.1% vs. 2.4%,图3B)。以10个突变/Mb作为高肿瘤突变负荷 (TMB-H)的临界值,CH+患者中TMB-H的比例更高 (25.7% vs. 22.4%,图3C),原因可能是衰老相关的TMB的增加 (图3D)。在一组多瘤种的175例独立队列中,过滤CH突变可改善基于Panel和外显子组的TMB评估之间的相关性 (未过滤0.822 vs 过滤0.842,图3E)。
图3 免疫治疗标志物与CH突变的相关性
结语
本研究采用世和一号®大Panel检测,通过肿瘤-血液配对测序方法对中国癌症患者中克隆性造血的概况及临床意义深度挖掘,并首次证明了CH突变过滤对于改善基于Panel测序的TMB评估在技术上的重要性,后续还需要开展大规模前瞻性研究来进一步评估CH突变过滤对免疫疗法结果预测的影响。世和基因从2015年开始率先在国内推出肿瘤液体活检产品,在产品推出前的研发阶段就已经发现了CH现象,并深入探究了CH突变的全面特征。而且,针对上述特征,世和基因在临床检测中进行了严格的白细胞检测对照和中国人群CH突变数据库比对,通过双重条件实现CH突变过滤,并进一步通过临床检测积累完善中国人CH突变数据库。
参考文献Li Z, Huang W, Yin J, et al. Comprehensive next-generation profiling of clonal hematopoiesis in cancer patients using paired tumor-blood sequencing for guiding personalized therapies. Clinical and Translational Medicine. 2020; 10: e222.